Illumina NovaSeq X Plus
Illumina NovaSeq 6000
NextSeq™ 2000
Illumina MiSeq
MGI DNBSEQ-T7
NextSeq™ 500
PacBio Sequel II
PacBio Sequel
PacBio Revio
PromethION24
Chromium controller
Chromium X
Visium CytAssist
CytoFLEX SRT 细胞分选仪
Orbitrap Exploris™ 120
Orbitrap Astral
timsTOF UItra
Q Exactive HF-X
分析内容及结果
聚类分析:两个不同阶段的肿瘤样本变异位点的聚类分析,横坐标代表不同的聚类群,纵坐标反应了等位基因的变异频率,图中标注的基因为驱动基因。上下两个图比较可看出肿瘤样本的不同阶段各个克隆群的变化情况。
蛋白互作网络分析 候选基因GO富集分析
变异可视化分析
肿瘤亚克隆结构与进化分析
染色体拷贝数分布及等位基因变异频率分析
染色体区域拷贝数变异分布